A história começa quando o detective particular Harry Goodman desaparece misteriosamente, levando seu filho Tim, de 21 anos, a tentar descobrir o que aconteceu.

     Quem ajuda na investigação é o antigo parceiro Pokémon de Harry, o Detective Pikachu: um adorável super detective divertido e brincalhão que é um enigma até para si mesmo.

     Após descobrirem que são capazes de se comunicar um com o outro, Tim e Pikachu unem forças numa aventura para desvendar esse mistério.

     Reunindo pistas pelas ruas de Ryme City ? uma gigantesca metrópole moderna onde seres humanos e Pokémons convivem lado a lado num mundo hiper-realista ?

    Eles encontram pelo caminho um elenco diversificado de personagens Pokémon e revelam um trama chocante que poderia arruinar essa coexistência pacífica e ameaçar todo o universo Pokémon.